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怎麼在omim網站上查資料

發布時間:2022-10-03 16:19:34

㈠ 如何用OMIM查找單基因遺傳病的總數

在NCBI網站,選擇OMIM(PUBMED下面),輸入基因名稱,你會獲得許多關於該基因的信息,其中就包括染色體定位。

㈡ 同時存在一個omim是什麼意思

OMIM 資料庫:可查詢任何遺傳病、性狀或基因的資料;這是已經在資料庫,有資料嗎?

㈢ 怎樣在OMIM資料庫中查找與某種疾病有關的基因急用,謝謝

你直接上OMIM搜索GBM就是,下面就出來了跟它相關的基因啊

㈣ 在NCBI上怎麼找到一個基因的外顯子和內含子

事實上,在NCBI有很多種辦法可以確定某個基因的外顯子或者內含子,當然還有UTR區域。今天我們來介紹NCBI的其中一個使用軟體Splign來在NCBI上找到一個基因的外顯子和內含子。操作步驟如下:

1.在Gene資料庫,填入基因名HNF-4,我一般的話習慣叫Symbol,每個基因都有個Symbol,即基因名。

㈤ 如何在網上查找一個疾病的所有相關基因

除了文獻以外,也可以考慮OMIM資料庫http://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim

這個資料庫的宗旨就是收集疾病及其相關基因的信息的。不過可能存在的問題就是對於疾病的劃分比較系統詳盡,不是說輸入個糖尿病就直接出來一個列表,它對疾病進行了更進一步的分類,需要你仔細看一看,而且對於疾病的描述是很詳盡的,不只是簡單一個列表,需要你仔細讀完,然後才能了解到底有什麼相關基因。不過好處就是相當於簡化了你找綜述得步驟,而且相對比較全面。

㈥ 怎麼查h19 icr區 基因序列

在NCBI上的OMIM資料庫輸入基因名,在TITLE上就會顯示它的學名。 用學名檢索基因是比較靠譜的。建議用ENSEMBL找基因,顯示其外顯子和內含子。進入ENSEMBL的方法有兩種,1.NCBI上進入基因的檢索條以後,summary里會有相應的ENSEMBL的鏈接(see related);2.直接進入ENSEMBL主頁檢索該基因。進入基因的檢索條以後,點左側的CDNA和EXONS就能相應地看到轉錄本的注釋信息,包括外顯子和內含子的注釋,5『和3』UTR的注釋,和密碼子的注釋。

㈦ 如何在NCBI上查到某個給定基因的序列,並且在序列中清楚的顯示出其中的外顯子和內含子

1、首先輸入基因的完整學名,找到與基因相關的cDNA序列。在這一cRNA序列的解說信息里,就已經有各外顯子的分節。
2、將該cDNA輸入Blast進行序列比對,就可以找到其每一個外顯子所對應的染色體位置,這些信息就顯示了所有的外顯子。處於外顯子兩端的序列就是內含子。
3、如你需要完整的基因序列,需要在blast中選擇others這個資料庫,然後查找相關的Bac質粒中含有你完整基因的文件,在其中找到你所需的信息。

㈧ 如何在NCBI上查找某個基因在染色體的位置,例如顯示出在第幾號染色體。。基因序列什麼的都清楚,就是不...

在NCBI網站,選擇OMIM(PUBMED下面),輸入基因名稱,你會獲得許多關於該基因的信息,其中就包括染色體定位。

㈨ 如何利用NCBI查詢蛋白質等電點

NCBI無法查詢蛋白質等電點,可以到swissprot查詢。

這個NCBI沒有相關的功能,這個是以核苷酸序列為主。因為等電點特性是蛋白質水平的分子特性,可以到swissprot進行查詢,查詢蛋白質等電點需要到專業的平台進行查詢。

另外NCBI開發有Genbank等公共資料庫,提供Pubmed、BLAST、Entrez、OMIM、Taxonomy等工具,可對國際分子資料庫和生物醫學文獻進行檢索和分析。

(9)怎麼在omim網站上查資料擴展閱讀:

NCBI開發用於分析基因組數據和傳播生物醫學信息的軟體工具。NCBI支持與推廣多種醫學及科技方面的資料庫,如:三維蛋白質結構的分子模型資料庫(MMDB)、孟德爾人類遺傳(OMIM)等。

另外使用CD-Search工具來可以鑒定蛋白質或者核酸序列內的保守結構域或功能單位。該工具位於NCBI中。可以進入NCBI後選擇ConservedDomain中的Search。

除此之外這個網站Search的黃色部分其中CD-search只能提交單條序列,BatchCD-Search可以上傳多條序列,裡面收錄的數據范圍是比較廣的,可以利用NCBI進行檢索。

㈩ 我已經在NCBI上用omim搜索到一批需要使用的基因了,怎麼進行序列進行批量下載呢或者其他批量下載方法。

OMIM資料庫之父Victor Almon McKusick先生是位臨床醫生。該資料庫的最原始的版本是一本叫MIM的遺傳學書籍,後來挪到了網上,就加了一個「O」稱為在線的人類孟德爾遺傳學。所以OMIM資料庫不同於其他的NCBI資料庫。其設計之初是為臨床醫生提供在線瀏覽的服務,因此沒有相應的序列下載服務。從另外一個角度來說,OMIM的每一條記錄討論的是某一個基因,而與這個基因相關的序列可能有幾條,幾十條甚至上百條的記錄。

要解決你的問題,如果數量不多,例如50以內。建議你手工通過OMIM提供的RefSeq的鏈接獲取。這個方法的優點是,你可以挑選你想要的序列(mRNA, DNA或Protein),消耗的時間上與編程差不多。

如果超過100,或需要反復做,就有編程的必要。你可以參考我提供的鏈接使用eUtils工具來獲取序列。

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